Feb. 06

Glutamin

Übersicht über NMR-Daten [1] zum Glutamin:

Glutamin Atom Atomtyp Chemische Verschiebung [ppm]1 Random Coil
chem. Verschiebung 3		 Random Coil
chem. Verschiebung 4
Mittelwert Standardabweichung Datenbasis2
H H  8.218  0.684  33299  8.32  8.29
Hα H  4.268  0.439  25740  4.34  4.65
Hβ2 H  2.042  0.273  23494  2.12  2.09
Hβ3 H  2.012  0.317  22302  1.99  1.93
Hγ2 H  2.312  0.351  22128  2.36  2.38
Hγ3 H  2.29  0.38 20418  2.36  2.38
Hε21 H  7.212  0.508  16963  7.52  7.53
Hε22 H  7.04  0.96  16868  6.85  6.88
C C  176.381  11.294  21300  176.0  174.4
Cα C  56.593  2.184  29520  55.7  53.7
Cβ C  29.211  2.091  27695  29.4  28.8
Cγ C  33.783  1.829  19117  33.7  33.4
Cδ C  179.252  7.944  2022  180.5  180.5
N N  119.871  3.968  31370  119.8  120.6
Nε2 N  111.86  2.146  15151  112.1  112.1
Anteil in Proteinen pK2 COOH pK1COOH isoelektrische
Punkt		 pK1NH2 pK2NH2
 7.5%  –  2.17  5.65  9.13  –
CAS- Nummer molare Masse Summenformel Dichte Schmelzpunkt Löslichkeit
  • 56-85-9 (L-Enantiomer)
  • 5959-95-5 (D-Enantiomer)
  • 585-21-7 (DL-Glutamin)
  146,15 g·mol−1  C5H10N2O3  185–186 °C
  • löslich in Wasser: 26 g·l−1 (18 °C)
  • unlöslich in Methanol, Benzol und Chloroform

1 abhängig vom Atomtyp handelte es sich um die 1H, 13C bzw. 15N chemische Verschiebung. 1H und 13C relativ zu TMS und 15N relativ zu flüssigem Ammoniak

2 Anzahl an individuellen Verschiebungsdaten zur Mittelwertbildung nach [2]

3 mit Alanin als Nachbarn in dem Hexapeptide Gly-Gly-X-Ala-Gly-Gly [3]

4 mit Prolin als Nachbarn in dem Hexapeptide Gly-Gly-X-Pro-Gly-Gly [3]

3D- Modell

Datenquellen:

[1] „BioMagResBank“, Eldon L. Ulrich; Hideo Akutsu; Jurgen F. Doreleijers; Yoko Harano; Yannis E. Ioannidis; Jundong Lin; Miron Livny; Steve Mading; Dimitri Maziuk; Zachary Miller; Eiichi Nakatani; Christopher F. Schulte; David E. Tolmie; R. Kent Wenger; Hongyang Yao; John L. Markley; Nucleic Acids Research 36, D402-D408 (2008) doi: 10.1093/nar/gkm957

[2] http://www.bmrb.wisc.edu/ zuletzt aufgerufen im Januar 2014

[3] David S. Wishart, Colin G. Bigam, Arne Holm, Robert S. Hodges, Brian D. Sykes; Journal of Biomolecular NMR
January 1995, Volume 5, Issue 1, pp 67-81 doi:10.1007/BF00227471

[4] Wikipedia http://de.wikipedia.org/wiki/Aminos%C3%A4uren (aufgerufen am 25. Januar 2014) und dortige Primärquellen

[5] Wikipedia http://de.wikipedia.org/wiki/Glutamin (aufgerufen am 5. Februar 2014) und dortige Primärquellen

3D Mol: Nicholas Rego and David Koes
3Dmol.js: molecular visualization with WebGL
Bioinformatics (2015) 31 (8): 1322-1324 doi:10.1093/bioinformatics/btu829

Post Views: 25

Feb. 05

Glutaminsäure

Übersicht über NMR-Daten [1] zur Glutaminsäure:

 Glutaminsaeure Atom Atomtyp Chemische Verschiebung [ppm]1 Random Coil
chem. Verschiebung 3		 Random Coil
chem. Verschiebung 4
Mittelwert Standardabweichung Datenbasis2
H H  8.332  0.687 62155  8.42  8.34
Hα H  4.247  0.437 47447  4.35  4.64
Hβ2 H  2.019  0.224 43261  2.06  2.06
Hβ3 H  1.994  0.232 40587  1.96  1.90
Hγ2 H  2.265  0.224 40309  2.31  2.31
Hγ3 H  2.244  0.228 37364  2.31  2.31
Hε2 H  7.171  3.299  5
C C  176.817  3.992 40322  176.6  174.9
Cα C  57.322  2.175 54861  56.6  54.2
Cβ C  30.027  2.138 51286  29.9  29.2
Cγ C  36.116  1.784 35173  35.6  35.0
Cδ C  181.333  11.754 751  183.4  183.0
N N  120.672  4.382 59032  120.2  121.7
Anteil in Proteinen pK2 COOH pK1COOH isoelektrische
Punkt		 pK1NH2 pK2NH2
 6.2%  4.25  2.19  3.22  9.67  –
CAS- Nummer molare Masse Summenformel Dichte Schmelzpunkt Löslichkeit
  • 56-86-0 (L-Enantiomer)
  • 6893-26-1 (D-Enantiomer)
  • 617-65-2 (DL-Glutaminsäure)
  147,13 g·mol−1  C5H9NO4  1,54 g·cm−3 (20 °C)  160 °C
  • schlecht in Wasser (11,1 g·l−1bei 25 °C)
  • schlecht in Ethanol, unlöslich in Diethylether, Aceton und Eisessig

1 abhängig vom Atomtyp handelte es sich um die 1H, 13C bzw. 15N chemische Verschiebung. 1H und 13C relativ zu TMS und 15N relativ zu flüssigem Ammoniak

2 Anzahl an individuellen Verschiebungsdaten zur Mittelwertbildung nach [2]

3 mit Alanin als Nachbarn in dem Hexapeptide Gly-Gly-X-Ala-Gly-Gly [3]

4 mit Prolin als Nachbarn in dem Hexapeptide Gly-Gly-X-Pro-Gly-Gly [3]

3D- Modell

Datenquellen:

[1] „BioMagResBank“, Eldon L. Ulrich; Hideo Akutsu; Jurgen F. Doreleijers; Yoko Harano; Yannis E. Ioannidis; Jundong Lin; Miron Livny; Steve Mading; Dimitri Maziuk; Zachary Miller; Eiichi Nakatani; Christopher F. Schulte; David E. Tolmie; R. Kent Wenger; Hongyang Yao; John L. Markley; Nucleic Acids Research 36, D402-D408 (2008) doi: 10.1093/nar/gkm957

[2] http://www.bmrb.wisc.edu/ zuletzt aufgerufen im März 2017

[3] David S. Wishart, Colin G. Bigam, Arne Holm, Robert S. Hodges, Brian D. Sykes; Journal of Biomolecular NMR
January 1995, Volume 5, Issue 1, pp 67-81 doi:10.1007/BF00227471

[4] Wikipedia http://de.wikipedia.org/wiki/Aminos%C3%A4uren (aufgerufen am 25. Januar 2014) und dortige Primärquellen

[5] Wikipedia http://de.wikipedia.org/wiki/Glutamins%C3%A4ure (aufgerufen am 5. Februar 2014) und dortige Primärquellen

3D Mol: Nicholas Rego and David Koes
3Dmol.js: molecular visualization with WebGL
Bioinformatics (2015) 31 (8): 1322-1324 doi:10.1093/bioinformatics/btu829

Post Views: 18

Feb. 05

Aprilwetter

Das Aprilwetter gilt als launisch und unberechenbar, der Grund dafür ist jedoch meteorologisch schnell gefunden: Der für Menschen unangenehme schnelle Wechsel von Sonne, Regen und sogar Schnee ist für die Entwicklung der Pflanzen genau richtig. Keime benötigen jetzt Feuchtigkeit ohne Staunässe und Sonne. Weil die Luft im Polargebiet und über dem nördlichen Atlantik noch kalt, die Luft über Europa jedoch schon wärmer ist, kommt es oft zu Regen- oder Schneeschauern, sobald die kalte Luft nach Europa zieht.

Post Views: 4

Feb. 04

Katzenstrom

Wenn Sie eine Katze 70 Millionen mal streicheln, werden Sie genug statische Elektrizität erzeugt habe um eine 60-Watt-Glühbirne für eine Minute Licht leuchten zu lassen.

Post Views: 5

Feb. 02

Top 6 Gründe für Zuspätkommen bei der Arbeit

1) Verkehr
2) verschlafen
3) Verzögerungen
4) Hausarbeiten
5) Autopanne
6) Sex

Post Views: 3

Jan. 31

Schallenergie

Wenn man 8,5 Jahre lang schreit, produziert man genug Schallenergie um eine Tasse Kaffee zu kochen.

Post Views: 3

Mehr lesen