Übersicht über NMR-Daten [1] zum Threonin:
Atom | Atomtyp | Chemische Verschiebung [ppm]1 | Random Coil chem. Verschiebung 3 |
Random Coil chem. Verschiebung 4 |
|||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Mittelwert | Standardabweichung | Datenbasis2 | |||||
H | H | 8.244 | 1.139 | 44831 | 8.15 | 8.15 | |
Hα | H | 4.458 | 0.556 | 34443 | 4.35 | 4.61 | |
Hβ | H | 4.172 | 0.837 | 31798 | 4.24 | 4.11 | |
Hγ1 | H | 5.311 | 1.322 | 1227 | – | – | |
Hγ2 | H | 1.139 | 0.331 | 31493 | 1.21 | 1.23 | |
C | C | 174.464 | 4.246 | 27922 | 174.7 | 173.2 | |
Cα | C | 62.245 | 2.658 | 38914 | 61.8 | 59.8 | |
Cβ | C | 69.599 | 6.601 | 36242 | 69.8 | 69.8 | |
Cγ2 | C | 21.591 | 1.984 | 25736 | 21.5 | 21.4 | |
N | N | 115.489 | 6.833 | 41840 | 113.6 | 116.0 | |
Anteil in Proteinen | pK2 COOH | pK1COOH | isoelektrische Punkt |
pK1NH2 | pK2NH2 | ||
6.0% | – | 2.1 | 5.6 | 9.12 | – | ||
CAS- Nummer | molare Masse | Summenformel | Dichte | Schmelzpunkt | Löslichkeit | ||
|
119,12 g·mol−1 | C4H9NO3 | 255–257 °C (Zersetzung)(L-Threonin) | schlecht in Wasser (90 g·l−1 bei 20 °C), unlöslich in organischen Lösungsmitteln |
1 abhängig vom Atomtyp handelte es sich um die 1H, 13C bzw. 15N chemische Verschiebung. 1H und 13C relativ zu TMS und 15N relativ zu flüssigem Ammoniak
2 Anzahl an individuellen Verschiebungsdaten zur Mittelwertbildung nach [2]
3 mit Alanin als Nachbarn in dem Hexapeptide Gly-Gly-X-Ala-Gly-Gly [3]
4 mit Prolin als Nachbarn in dem Hexapeptide Gly-Gly-X-Pro-Gly-Gly [3]
3D- Modell
Datenquellen:
[1] „BioMagResBank“, Eldon L. Ulrich; Hideo Akutsu; Jurgen F. Doreleijers; Yoko Harano; Yannis E. Ioannidis; Jundong Lin; Miron Livny; Steve Mading; Dimitri Maziuk; Zachary Miller; Eiichi Nakatani; Christopher F. Schulte; David E. Tolmie; R. Kent Wenger; Hongyang Yao; John L. Markley; Nucleic Acids Research 36, D402-D408 (2008) doi: 10.1093/nar/gkm957
[2] http://www.bmrb.wisc.edu/ zuletzt aufgerufen im März 2017
[3] David S. Wishart, Colin G. Bigam, Arne Holm, Robert S. Hodges, Brian D. Sykes; Journal of Biomolecular NMR
January 1995, Volume 5, Issue 1, pp 67-81 doi:10.1007/BF00227471
[4] Wikipedia http://de.wikipedia.org/wiki/Aminos%C3%A4uren (aufgerufen am 25. Januar 2014) und dortige Primärquellen
[5] Wikipedia http://de.wikipedia.org/wiki/Threonin (aufgerufen am 12. Februar 2014) und dortige Primärquellen
3D Mol: Nicholas Rego and David Koes
3Dmol.js: molecular visualization with WebGL
Bioinformatics (2015) 31 (8): 1322-1324 doi:10.1093/bioinformatics/btu829