Histidin

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Übersicht über NMR-Daten [1] zum Histidin:

Histidin Atom Atomtyp Chemische Verschiebung [ppm]1 Random Coil
chem. Verschiebung 3
Random Coil
chem. Verschiebung 4
Mittelwert Standardabweichung Datenbasis2
H H  8.261  0.746 17517 8.42 8.37
H  4.62  0.614 13920 4.73 5.00
Hβ2 H  3.175  1.199 13026 3.29 3.23
Hβ3 H  3.107  1.141 12659 3.16 3.12
Hδ1 H  10.356  9.354 841
Hδ2 H  7.201  3.606 9406 7.29 7.29
Hε1 H  7.809  2.350 7460 8.58 8.57
Hε2 H  11.407  8.532 325
C C  175.110  4.876 10830 174.1 172.6
C  56.521  2.80 15550 55.0 53.3
C  30.294  2.418 4662 29.0 29.0
C  131.214  8.018 169 131.1 131.2
Cδ2 C  119.917  5.929 5908 120.1 120.3
Cε1 C  137.278  5.448 4641 136.2 136.3
N N  119.637  4.80 16062 118.2 118.2
Nδ1 N  193.065  33.590 642
Nε2 N  180.661  21.090 601
Anteil in Proteinen pK2 COOH pK1COOH isoelektrische
Punkt
pK1NH2 pK2NH2
 2.1%  –  1.78  7.47  8.97  5.97
CAS- Nummer molare Masse Summenformel Dichte Schmelzpunkt Löslichkeit
  • 71-00-1 (L-Enantiomer)
  • 351-50-8 (D-Enantiomer)
  • 4998-57-6 (DL-Histidin)
 155,16 g·mol−1  C6H9N3O2  287°C (Zersetzung)  schlecht in Wasser (38,2 g·l−1 bei 20°C)

1 abhängig vom Atomtyp handelte es sich um die 1H, 13C bzw. 15N chemische Verschiebung. 1H und 13C relativ zu TMS und 15N relativ zu flüssigem Ammoniak

2 Anzahl an individuellen Verschiebungsdaten zur Mittelwertbildung nach [2]

3 mit Alanin als Nachbarn in dem Hexapeptide Gly-Gly-X-Ala-Gly-Gly [3]

4 mit Prolin als Nachbarn in dem Hexapeptide Gly-Gly-X-Pro-Gly-Gly [3]


3D- Modell

Datenquellen:

[1] „BioMagResBank“, Eldon L. Ulrich; Hideo Akutsu; Jurgen F. Doreleijers; Yoko Harano; Yannis E. Ioannidis; Jundong Lin; Miron Livny; Steve Mading; Dimitri Maziuk; Zachary Miller; Eiichi Nakatani; Christopher F. Schulte; David E. Tolmie; R. Kent Wenger; Hongyang Yao; John L. Markley; Nucleic Acids Research 36, D402-D408 (2008) doi: 10.1093/nar/gkm957

[2] http://www.bmrb.wisc.edu/ zuletzt aufgerufen im März 2017

[3] David S. Wishart, Colin G. Bigam, Arne Holm, Robert S. Hodges, Brian D. Sykes; Journal of Biomolecular NMR
January 1995, Volume 5, Issue 1, pp 67-81 doi:10.1007/BF00227471

[4] Wikipedia http://de.wikipedia.org/wiki/Aminos%C3%A4uren (aufgerufen am 25. Januar 2014) und dortige Primärquellen

[5] Wikipedia http://de.wikipedia.org/wiki/Histidin (aufgerufen am 25. Januar 2014) und dortige Primärquellen

3D Mol: Nicholas Rego and David Koes
3Dmol.js: molecular visualization with WebGL
Bioinformatics (2015) 31 (8): 1322-1324 doi:10.1093/bioinformatics/btu829

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