Übersicht über NMR-Daten [1] zum Valin:
Atom | Typ | Chemische Verschiebung [ppm]1 | Random Coil chem. Verschiebung 3 |
Random Coil chem. Verschiebung 4 |
|||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Mittelwert | σ5 | Daten2 | |||||
H | H | 8.28 | 0.687 | 55381 | 8.03 | 8.02 | |
Hα | H | 4.172 | 0.646 | 42441 | 4.12 | 4.44 | |
Hβ | H | 1.976 | 0.474 | 39770 | 2.08 | 2.06 | |
Hγ1 | H | 0.82 | 0.35 | 39325 | 0.94 | 0.97 | |
Hγ2 | H | 0.80 | 0.462 | 38582 | 0.93 | 0.92 | |
C | C | 175.638 | 3.242 | 35667 | 176.3 | 174.9 | |
Cα | C | 62.529 | 2.903 | 48856 | 62.2 | 59.8 | |
Cβ | C | 32.746 | 2.103 | 45470 | 32.9 | 32.6 | |
Cγ1 | C | 21.527 | 1.897 | 33534 | 21.1 | 20.9 | |
Cγ2 | C | 21.324 | 2.043 | 32334 | 20.3 | 20.1 | |
N | N | 121.205 | 8.171 | 52437 | 119.2 | 120.5 | |
Anteil in Proteinen | pK2 COOH | pK1COOH | isoelektrischer Punkt | pK1NH2 | pK2NH2 | ||
6.9% | – | 2.30 | 5.96 | 9.60 | – | ||
CAS- Nummer | molare Masse | Formel | Löslichkeit | Schmelzpunkt | Dichte | ||
|
117,15 g·mol−1 | C5H11NO2 | 295–300 °C | 1,23 g·cm−3 |
1 abhängig vom Atomtyp handelte es sich um die 1H, 13C bzw. 15N chemische Verschiebung. 1H und 13C relativ zu TMS und 15N relativ zu flüssigem Ammoniak
2 Anzahl an individuellen Verschiebungsdaten zur Mittelwertbildung nach [2]
3 mit Alanin als Nachbarn in dem Hexapeptide Gly-Gly-X-Ala-Gly-Gly [3]
4 mit Prolin als Nachbarn in dem Hexapeptide Gly-Gly-X-Pro-Gly-Gly [3]
5 Standardabweichung
3D- Modell
Datenquellen:
[1] „BioMagResBank“, Eldon L. Ulrich; Hideo Akutsu; Jurgen F. Doreleijers; Yoko Harano; Yannis E. Ioannidis; Jundong Lin; Miron Livny; Steve Mading; Dimitri Maziuk; Zachary Miller; Eiichi Nakatani; Christopher F. Schulte; David E. Tolmie; R. Kent Wenger; Hongyang Yao; John L. Markley; Nucleic Acids Research 36, D402-D408 (2008) doi: 10.1093/nar/gkm957
[2] http://www.bmrb.wisc.edu/ zuletzt aufgerufen im März 2017
[3] David S. Wishart, Colin G. Bigam, Arne Holm, Robert S. Hodges, Brian D. Sykes; Journal of Biomolecular NMR
January 1995, Volume 5, Issue 1, pp 67-81 doi:10.1007/BF00227471
[4] Wikipedia http://de.wikipedia.org/wiki/Aminos%C3%A4uren (aufgerufen am 25. Januar 2014) und dortige Primärquellen
[5] Wikipedia http://de.wikipedia.org/wiki/Valin (aufgerufen am 15. Februar 2014) und dortige Primärquellen
3D Mol: Nicholas Rego and David Koes
3Dmol.js: molecular visualization with WebGL
Bioinformatics (2015) 31 (8): 1322-1324 doi:10.1093/bioinformatics/btu829