Übersicht über NMR-Daten [1] zur Glutaminsäure:
Atom | Atomtyp | Chemische Verschiebung [ppm]1 | Random Coil chem. Verschiebung 3 |
Random Coil chem. Verschiebung 4 |
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Mittelwert | Standardabweichung | Datenbasis2 | |||||
H | H | 8.332 | 0.687 | 62155 | 8.42 | 8.34 | |
Hα | H | 4.247 | 0.437 | 47447 | 4.35 | 4.64 | |
Hβ2 | H | 2.019 | 0.224 | 43261 | 2.06 | 2.06 | |
Hβ3 | H | 1.994 | 0.232 | 40587 | 1.96 | 1.90 | |
Hγ2 | H | 2.265 | 0.224 | 40309 | 2.31 | 2.31 | |
Hγ3 | H | 2.244 | 0.228 | 37364 | 2.31 | 2.31 | |
Hε2 | H | 7.171 | 3.299 | 5 | |||
C | C | 176.817 | 3.992 | 40322 | 176.6 | 174.9 | |
Cα | C | 57.322 | 2.175 | 54861 | 56.6 | 54.2 | |
Cβ | C | 30.027 | 2.138 | 51286 | 29.9 | 29.2 | |
Cγ | C | 36.116 | 1.784 | 35173 | 35.6 | 35.0 | |
Cδ | C | 181.333 | 11.754 | 751 | 183.4 | 183.0 | |
N | N | 120.672 | 4.382 | 59032 | 120.2 | 121.7 | |
Anteil in Proteinen | pK2 COOH | pK1COOH | isoelektrische Punkt |
pK1NH2 | pK2NH2 | ||
6.2% | 4.25 | 2.19 | 3.22 | 9.67 | – | ||
CAS- Nummer | molare Masse | Summenformel | Dichte | Schmelzpunkt | Löslichkeit | ||
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147,13 g·mol−1 | C5H9NO4 | 1,54 g·cm−3 (20 °C) | 160 °C |
1 abhängig vom Atomtyp handelte es sich um die 1H, 13C bzw. 15N chemische Verschiebung. 1H und 13C relativ zu TMS und 15N relativ zu flüssigem Ammoniak
2 Anzahl an individuellen Verschiebungsdaten zur Mittelwertbildung nach [2]
3 mit Alanin als Nachbarn in dem Hexapeptide Gly-Gly-X-Ala-Gly-Gly [3]
4 mit Prolin als Nachbarn in dem Hexapeptide Gly-Gly-X-Pro-Gly-Gly [3]
3D- Modell
Datenquellen:
[1] „BioMagResBank“, Eldon L. Ulrich; Hideo Akutsu; Jurgen F. Doreleijers; Yoko Harano; Yannis E. Ioannidis; Jundong Lin; Miron Livny; Steve Mading; Dimitri Maziuk; Zachary Miller; Eiichi Nakatani; Christopher F. Schulte; David E. Tolmie; R. Kent Wenger; Hongyang Yao; John L. Markley; Nucleic Acids Research 36, D402-D408 (2008) doi: 10.1093/nar/gkm957
[2] http://www.bmrb.wisc.edu/ zuletzt aufgerufen im März 2017
[3] David S. Wishart, Colin G. Bigam, Arne Holm, Robert S. Hodges, Brian D. Sykes; Journal of Biomolecular NMR
January 1995, Volume 5, Issue 1, pp 67-81 doi:10.1007/BF00227471
[4] Wikipedia http://de.wikipedia.org/wiki/Aminos%C3%A4uren (aufgerufen am 25. Januar 2014) und dortige Primärquellen
[5] Wikipedia http://de.wikipedia.org/wiki/Glutamins%C3%A4ure (aufgerufen am 5. Februar 2014) und dortige Primärquellen
3D Mol: Nicholas Rego and David Koes
3Dmol.js: molecular visualization with WebGL
Bioinformatics (2015) 31 (8): 1322-1324 doi:10.1093/bioinformatics/btu829