Übersicht über NMR-Daten [1] zum Arginin:
Atom | Atomtyp | Chemische Verschiebung [ppm]1 | Random Coil chem. Verschiebung 3 |
Random Coil chem. Verschiebung 4 |
|||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Mittelwert | Standard- abweichung |
Datenbasis2 | |||||
H | H | 8.24 | 0.627 | 40130 | 8.23 | 8.20 | |
Hα | H | 4.293 | 0.476 | 31190 | 4.34 | 4.65 | |
Hβ2 | H | 1.789 | 0.323 | 28470 | 1.86 | 1.81 | |
Hβ3 | H | 1.756 | 0.336 | 26878 | 1.76 | 1.81 | |
Hγ2 | H | 1.558 | 0.287 | 25624 | 1.63 | 1.67 | |
Hγ3 | H | 1.537 | 0.302 | 23633 | 1.63 | 1.67 | |
Hδ2 | H | 3.106 | 0.274 | 25181 | 3.20 | 3.21 | |
Hδ3 | H | 3.089 | 0.295 | 22830 | 3.20 | 3.21 | |
Hε | H | 7.469 | 3.158 | 8731 | 8.07 | 8.07 | |
Hη11 | H | 6.915 | 0.56 | 821 | |||
Hη12 | H | 6.846 | 0.500 | 625 | |||
Hη21 | H | 6.801 | 0.676 | 701 | |||
Hη22 | H | 6.877 | 2.300 | 579 | |||
C | C | 176.39 | 3.391 | 24360 | 176.3 | 174.5 | |
Cα | C | 56.77 | 2.442 | 34263 | 56.0 | 54.0 | |
Cβ | C | 30.72 | 2.161 | 32008 | 30.9 | 30.2 | |
Cγ | C | 27.23 | 1.678 | 20933 | 27.1 | 26.8 | |
Cδ | C | 43.169 | 1.54 | 21197 | 43.3 | 43.4 | |
Cζ | C | 160.246 | 6.468 | 566 | 159.5 | 159.6 | |
N | N | 120.758 | 4.197 | 36557 | 120.5 | 121.3 | |
Nε | N | 90.604 | 13.498 | 5550 | |||
Nη1 | N | 79.911 | 13.90 | 214 | |||
Nη2 | N | 79.555 | 15.263 | 188 | |||
Anteil in Proteinen | pK2 COOH | pK1COOH | isoelektrische Punkt |
pK1NH2 | pK2NH2 | ||
4.7% | – | 2.81 | 11.76 | 9.09 | 13.2 | ||
CAS- Nummer | molare Masse | Summenformel | Dichte | Schmelzpunkt | Löslichkeit | ||
|
|
|
0,7 g·cm−3 | 238 °C | gut in Wasser (150 g·l−1 bei 20 °C) |
1 abhängig vom Atomtyp handelte es sich um die 1H, 13C bzw. 15N chemische Verschiebung. 1H und 13C relativ zu TMS und 15N relativ zu flüssigem Ammoniak
2 Anzahl an individuellen Verschiebungsdaten zur Mittelwertbildung nach [2]
3 mit Alanin als Nachbarn in dem Hexapeptide Gly-Gly-X-Ala-Gly-Gly [3]
4 mit Prolin als Nachbarn in dem Hexapeptide Gly-Gly-X-Pro-Gly-Gly [3]
3D- Modell
Datenquellen:
[1] „BioMagResBank“, Eldon L. Ulrich; Hideo Akutsu; Jurgen F. Doreleijers; Yoko Harano; Yannis E. Ioannidis; Jundong Lin; Miron Livny; Steve Mading; Dimitri Maziuk; Zachary Miller; Eiichi Nakatani; Christopher F. Schulte; David E. Tolmie; R. Kent Wenger; Hongyang Yao; John L. Markley; Nucleic Acids Research 36, D402-D408 (2008) doi: 10.1093/nar/gkm957
[2] http://www.bmrb.wisc.edu/ zuletzt aufgerufen im Januar 2017
[3] David S. Wishart, Colin G. Bigam, Arne Holm, Robert S. Hodges, Brian D. Sykes; Journal of Biomolecular NMR
January 1995, Volume 5, Issue 1, pp 67-81 doi:10.1007/BF00227471
[4] Wikipedia http://de.wikipedia.org/wiki/Aminos%C3%A4uren (aufgerufen am 25. Januar 2014) und dortige Primärquellen
[5] Wikipedia hhttp://de.wikipedia.org/wiki/Arginin (aufgerufen am 25. Januar 2014) und dortige Primärquellen
3D Mol: Nicholas Rego and David Koes
3Dmol.js: molecular visualization with WebGL
Bioinformatics (2015) 31 (8): 1322-1324 doi:10.1093/bioinformatics/btu829