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Jan 25

Alanin

Übersicht über NMR-Daten [1] zum Alanin:

alanin Atom Atomtyp Chemische Verschiebung [ppm]1 Random Coil
chem. Verschiebung 3
Random Coil
chem. Verschiebung 4
Mittelwert Standardabweichung Datenbasis2
H H 8.193 0.658 60330 8.24 8.19
H 4.25 0.448 45753 4.32 4.62
H 1.352 0.285 43360 1.39 1.35
C C 177.73 3.627 38367 177.8 175.9
C 53.163 2.087 52586 52.5 50.5
C 19.06 2.412 49713 19.1 18.1
N N 123.318 6.449 56493 123.8 125.0
Anteil in Proteinen  pK2 COOH pK1COOH isoelektrische
Punkt
pK1NH2 pK2NH2
9.0%  –  2.3  6.1  9.9  –
CAS- Nummer  molare Masse Summenformel Dichte Schmelzpunkt Löslichkeit
56-41-7 (L-Alanin)
338-69-2 (D-Alanin)
302-72-7 (DL-Alanin)
89.10 g/mol C3H7NO2 1,42 g·cm−3 295–297 °C (Zersetzung) gut löslich in Wasser
(166,5 g·kg−1 bei 25 °C;
217,9 g·kg−1 bei 50 °C;
285,1 g·kg−1 bei 75 °C;
373,0 g·kg−1 bei 100 °C)[4]
schlecht löslich in Ethanol
unlöslich in Diethylether

1 abhängig vom Atomtyp handelte es sich um die 1H, 13C bzw. 15N chemische Verschiebung. 1H und 13C relativ zu TMS und 15N relativ zu flüssigem Ammoniak

2 Anzahl an individuellen Verschiebungsdaten zur Mittelwertbildung nach [2]

3 mit Alanin als Nachbarn in dem Hexapeptide Gly-Gly-X-Ala-Gly-Gly [3]

4 mit Prolin als Nachbarn in dem Hexapeptide Gly-Gly-X-Pro-Gly-Gly [3]


3D- Modell

Datenquellen:

[1] „BioMagResBank“, Eldon L. Ulrich; Hideo Akutsu; Jurgen F. Doreleijers; Yoko Harano; Yannis E. Ioannidis; Jundong Lin; Miron Livny; Steve Mading; Dimitri Maziuk; Zachary Miller; Eiichi Nakatani; Christopher F. Schulte; David E. Tolmie; R. Kent Wenger; Hongyang Yao; John L. Markley; Nucleic Acids Research 36, D402-D408 (2008) doi: 10.1093/nar/gkm957

[2] http://www.bmrb.wisc.edu/ zuletzt aufgerufen im März 2017

[3] David S. Wishart, Colin G. Bigam, Arne Holm, Robert S. Hodges, Brian D. Sykes; Journal of Biomolecular NMR
January 1995, Volume 5, Issue 1, pp 67-81 doi:10.1007/BF00227471

[4] Wikipedia http://de.wikipedia.org/wiki/Aminos%C3%A4uren (aufgerufen am 25. Januar 2014) und dortige Primärquellen

[5] Wikipedia http://de.wikipedia.org/wiki/Alanin (aufgerufen am 25. Januar 2014) und dortige Primärquellen

3D Mol: Nicholas Rego and David Koes
3Dmol.js: molecular visualization with WebGL
Bioinformatics (2015) 31 (8): 1322-1324 doi:10.1093/bioinformatics/btu829

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